Arrakis er en ørkenverden, tilsyneladende død og øde, men her ligger den vigtigste ressource i galaksen: Spice. Uden Spice er rumrejser umulige, og mennesker bliver små klynger på isolerede planeter. Det ædle Hus, der kontrollerer Arrakis og produktionen af Spice, udøver stor magt. Kejseren gav Arrakis til Hus Atreides, men derefter konspirerede han for at erstatte dem med deres gamle rivaler, Hus Harkonnen. Baron Harkonnen knuste Atreides i et forræderisk angreb, og hersker nu over planeten med hård hånd. Men Paul og Jessica, arvinger til Hus Atreides, er i live og iværksætter et oprør med hjælp fra de frygtede Fremen, de mystiske indbyggere i de øde vidder på Arrakis.
Kun et Hus vil komme sejrrigt ud af den kommende kamp, mens det andet vil gå tabt i ørkenens sand. Det er ind i denne dystre virkelighed, spillere bliver kastet ind i i Dune: Krig for Arrakis.
I dette asymmetriske strategispil kæmper spillere om kontrol over planeten, manøvrerer tropper som Fremen, Fedaykin og de frygtindgydende Sardaukar, mens de sender Spice-høstere ud i den dybe ørken og tør at udfordre de store Sandorme. Spillet har et handlingsterningsystem med talrige eventkort, der vil muliggøre, at spillere kan genfortælle Dune-sagaen på forskellige måder med hver spilgennemgang.
